目前，日本作为加工原料所使用的玉米全部从国外进口，其最大玉米进口国是美国，而美国90%的玉米是转基因品种。在玉米栽培，流通，生产过程中，与转基因品种严格区分管理的标示为“非转基因”，而几乎全部为转基因的玉米标示为“无区分”品种。目前日本进口的大部分玉米作为清凉饮料的原料和动物饲料所使用，均属于（与转基因）“无区分”品种。
那么日本的啤酒行业有没有使用转基因玉米呢？今年10月对日本的4大啤酒公司，朝日、麒麟、札幌、三得利进行了调查。目前为止，这4家啤酒公司答复一直以非转基因玉米为原料，但发泡酒和第三代啤酒逐步使用以转基因玉米为原料的液糖。改用转基因玉米为原料的具体时间，各公司答复：三得利为今年2月，朝日为今年3月，麒麟为今年初，札幌啤酒没明确其时间。
关于啤酒，其他3家公司使用非转基因玉米，仅三得利不使用玉米原料。
日本 “主妇联合会”称，应制定欧盟一样严格而通俗易懂的转基因标示制度，即使最终产品中不存在转基因成分也应进行标示，以便保证“消费者选择权”。
