近日,西北农林科技大学动科学院动物基因组与基因功能研究团队在中国家驴遗传结构和体型大小受选择信号领域取得进展,在《Journalof Genetics and Genomics》(中科院1区TOP期刊)上在线发表了题为《Genomic Analyses Reveal Distinct Genetic Architectures and Selective Pressures in Chinese Donkeys》的研究论文。我院在读博士研究生沈加飞、于杰和代学雷为论文的第一作者,党瑞华副教授为通讯作者。
该研究选取中国家驴12个代表性地方品种共78个样本进行全基因组重测序,结合从公共数据库下载的11个野驴全基因组数据共同进行分析,发现中国家驴祖先来源比较单一,但在群体结构上具有明显的地理分布特征,分为华北平原驴、黄土高原驴和西南高原驴三类。
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(A)家驴群体结构;(B)家驴NJ树;(C)家驴选择信号与基因型分析
为揭示中国家驴体型差异的遗传机制,研究人员对大型驴、中型驴和小型驴进行受选择分析,在家驴3号染色体上发现2个与体高发育密切相关的明星基因NCAPG和LCORL,分别有11个和5个错义突变位点,共同组成的基因型可以把大型驴与小型驴分开。
该研究解析了中国家驴的群体遗传结构,筛选出影响中国家驴体型大小的关键候选基因与SNP错义突变位点,为揭示中国家驴地方品种的遗传多样性、品种形成的遗传机制及品种改良提供了理论依据。
全文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721001776