大黄鱼是我国产量最高的海水养殖鱼类，年产量超过25万吨。随着近几年大黄鱼产业的转型升级以及深远海养殖的快速发展，优良品种创制显得尤为迫切。为解决产业难点，创建深远海养殖大黄鱼精准高效育种技术体系，中国水产科学研究院东海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室大黄鱼遗传育种团队成功研发“东海芯1号”大黄鱼15K基因组育种芯片。这是东海所为培育适宜深远海养殖大黄鱼新品种所特制的种业芯片，且检测+预测周期小于14天，检测成本不超百元。
“东海芯1号”育种芯片是基于大黄鱼速生、高肌肉弹性和抗流选育参考群体（每个群体样本数量均≥300尾）高深度重测序数据及2000余尾液相芯片分型数据，结合GenoBaits?技术体系开发而成，包括1173个GWAS分析性状关联标记，以及14119个基于遗传连锁关系挑选的基因组均匀分布的背景位点。该技术能够实现大黄鱼快速、精准、高效的分子育种，可加快育种过程，提高育种效率，进一步推动大黄鱼种业创新与产业高质量发展。
“东海芯1号”芯片由东海所与博瑞迪联合研发，研发过程中得到了厦门大学徐鹏教授团队、中国水产科学研究院渔业工程研究所许建研究员团队的技术支持。该芯片具有基因组上均匀分布、高多态性等特点，可以实现高效的群体划分、分子标记辅助选育、全基因组选择等诸多功能，部分性状基因组选择预测准确度最高可达0.66，证明该芯片在基因组选育中具有较好的应用前景。
近年来，东海所深化大黄鱼全产业链联合攻关，在育种方面与宁德市富发水产有限公司、厦门大学、中国水产科学研究院渔业工程研究所、浙江省舟山市水产研究所等单位合作，聚焦深远海养殖大黄鱼种业需求，创制了多个大黄鱼新种质和新品系。
