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山东省农业科学院植保所在解析微小型卵寄生蜂染色体水平基因组方面取得新进展

放大字体  缩小字体 发布日期:2025-03-31  来源:山东省农业科学院  浏览次数:14
核心提示:解析了螟黄赤眼蜂(Trichogramma chilonis)的单倍型全基因组序列,是首个公开发布的赤眼蜂染色体水平的高质量参考基因组。
  近日,植保所天敌与授粉昆虫利用创新团队在Nature旗下期刊Scientific Data(Q1,5-year IF = 8.9)发表题为“A chromosomal-level genome assembly of Trichogramma chilonis Ishii, 1941 (Hymenoptera: Trichogrammatidae)”的研究论文,解析了螟黄赤眼蜂(Trichogramma chilonis)的单倍型全基因组序列,是首个公开发布的赤眼蜂染色体水平的高质量参考基因组。
 
  赤眼蜂(Trichogramma spp.)是一种微小型卵寄生蜂,以各种鳞翅目害虫的卵为食,常用于农业害虫管理。目前,这类微小型寄生蜂的高质量基因组资源十分匮乏,阻碍了我们对该群体的种群进化和寄生生态学的理解。本研究通过整合PacBio HiFi、Illumina和Hi-C数据,获得了螟黄赤眼蜂(T. chilonis)的染色体水平基因组。基因组大小为202.48 Mb,N50长度为40.00 Mb。共有98.59% (199.63 Mb)的contigs被有效地映射到5条染色体上。BUSCO测序结果显示,该基因组组装完整性为98.1% (n = 1367),其中95%为单拷贝BUSCOs, 3.1%为重复BUSCOs。此外,基因组包含24.16% (48.91 Mb)重复序列和12,163个预测的蛋白质编码基因。本研究中所展示的高质量的螟黄赤眼蜂基因组为阐明其进化路径和寄生生态潜在的分子机制提供了宝贵的资源。
 
  山东省农业科学院植物保护研究所为该文章的第一完成单位,植保所博士后王成兴为文章第一作者,翟一凡研究员为文章通讯作者。该研究得到国家重点研发计划和山东省泰山学者青年专家项目的支持。(撰稿:王成兴; 核稿:周起先)
 
关键词: 基因
 

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