罗非鱼是全球养殖产量第二的鱼类品种，杂交繁育的规模化推进带动了我国罗非鱼产业快速发展，同时也使种质资源精准鉴定与保种工作尤为关键。珠江水产研究所罗非鱼科研团队成功构建涵盖尼罗罗非鱼、莫桑比克罗非鱼、奥利亚罗非鱼、萨罗罗非鱼、以色列红罗非鱼及我国台湾地区培育的彩虹鲷、豹纹红等7类罗非鱼种质的全基因组遗传变异图谱。
群体遗传结构分析显示，莫桑比克罗非鱼、萨罗罗非鱼与奥利亚罗非鱼种质遗传背景保存完整，尼罗罗非鱼已分化出多个杂交品系，仅少量个体保留纯正GIFT选育原始谱系。彩虹鲷、豹纹红两类红罗非鱼均为杂交后代，与母本莫桑比克罗非鱼的遗传分化距离更远。研究定位到LG14染色体28140001–28290000区间发生串联重复扩增的色素调控基因DHRS11，该基因在母本莫桑比克罗非鱼中受到正向选择，较父本尼罗罗非鱼差异显著，而彩虹鲷、豹纹红相较莫桑比克罗非鱼受到更强的选择压力，表明DHRS11是调控两类红罗非鱼体色形成的关键基因。
团队借助机器学习多项逻辑回归模型筛选出40个物种特异性SNP标记，区分7种罗非鱼种质的判别准确率达99.61%；进一步精简为24个位点的低密度分子标记组合，准确率仍维持在98.2%。该研究揭示了罗非鱼体色调控新机制，搭建了可规模化应用的种质分子鉴别技术体系，为罗非鱼种质鉴定与纯种保藏提供了有力工具。
相关研究成果以“Genome-wide population structure and a molecular system to precise identification of tilapia genetic resources in China”为题发表于水产领域专业期刊Aquaculture（2026, 743808）。王章助理研究员为第一作者，可小丽特聘研究员为通讯作者。
该研究获得国家现代农业产业技术体系（CARS-46）、国家自然科学基金（32102834）及海南省重点研发计划（ZDYF2023XDNY063）等资助。相关成果已授权发明专利1件（CN 120945062 B）。
